[us-commits] [ehb54/ultrascan3] b94cd0: Re-up somo integration - removed develop, edit som...
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Thu Dec 12 01:04:30 MST 2019
Branch: refs/heads/somo-integrate
Home: https://github.com/ehb54/ultrascan3
Commit: b94cd0680fbba0bef0413bf4a86724c13745c357
https://github.com/ehb54/ultrascan3/commit/b94cd0680fbba0bef0413bf4a86724c13745c357
Author: = <kip.jay at phynix.io>
Date: 2019-12-12 (Thu, 12 Dec 2019)
Changed paths:
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A somo/3dplot/D_calc.cpp
A somo/3dplot/D_calc.h
A somo/3dplot/README
A somo/3dplot/colormapreader.cpp
A somo/3dplot/colormapreader.h
A somo/3dplot/femreader.h
A somo/3dplot/functions.h
A somo/3dplot/lightingdlg.cpp
A somo/3dplot/lightingdlg.h
A somo/3dplot/lightingdlgbase.cpp
A somo/3dplot/lightingdlgbase.h
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A somo/3dplot/mesh.cpp
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A somo/3dplot/mesh2mainwindow.h
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A somo/3dplot/mesh2mainwindowbase.h
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R somo/demo/8RATNC.pdb
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R somo/demo/lyzexp.dat
R somo/demo/lyzexp.out
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A somo/doc/README
A somo/doc/colors.pl
A somo/doc/hplctree.txt
A somo/doc/hydrotree.txt
A somo/doc/sastree.txt
A somo/doc/somotree.txt
A somo/doc/tree.pl
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A somo/etc/black-green.map
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A somo/etc/dmd/bbind02.May.lib
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A somo/etc/dmd/medupar_molecule.nonb
A somo/etc/dmd/medutop.pro
A somo/etc/flash-combined-no-text.png
A somo/etc/green-black.map
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A somo/etc/somo3_icon_1024x1024.png
A somo/etc/somo3_icon_128x128.ico
A somo/etc/somo3_icon_128x128.png
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A somo/etc/somo3_icon_16x16.png
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A somo/etc/somo3_icon_256x256.png
A somo/etc/somo3_icon_32x32.ico
A somo/etc/somo3_icon_32x32.png
A somo/etc/somo3_icon_512x512.ico
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A somo/etc/somo3_icon_64x64.png
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A somo/etc/vdwf.json
A somo/etc/yellow-black.map
A somo/extra/doc/Doxyfile
A somo/extra/doc/README
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A somo/extra/doc/fix_high_ascii_in_manual.pl
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A somo/extra/genapp/source/dammin
A somo/extra/genapp/source/dammin_cluster
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A somo/extra/genapp/templates/standard.h
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A somo/extra/haddock/notes
A somo/extra/haddock/stampede/mkhjob.pl
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A somo/extra/haddock/stampede/runonnode.pl
A somo/extra/haddock/stampede/usenode.pl
A somo/extra/osx/apprun
A somo/extra/osx/termrun
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A somo/extra/pdfmanual/pdfmanual.pl
A somo/extra/pdfmanual/somo_hplc.txt
A somo/extra/perl/rcoaltobm.pl
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A somo/extra/windev/copytodist.sh
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A somo/extra/windev/qt5/notes
A somo/extra/windev/qt5/us2.ci
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A somo/somo/doc/manual/somo/somo_icon_128.ico
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_icon_128.png
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A somo/somo/doc/manual/somo/somo_icon_32.png
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A somo/somo/doc/manual/somo/somo_residue.html
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A somo/somo/doc/manual/somo/somo_save.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_buffer.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_conc.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_hplc.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_hplc_fit.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_hplc_linear_baselines.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_hplc_movie.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_hplc_skewedGauss.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_hplc_svd.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_iqq_residuals.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_load_csv.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_mw.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_saxs_options.html
A somo/somo/doc/manual/somo/somo_show_hydro.html
A somo/somo/doc/manual/somo/underconstruction.html
A somo/somo/doc/manual/somo/underconstruction.png
A somo/somo/doc/manual/somo/vbar_symbol.png
A somo/somo/test/configs/atom1.config
A somo/somo/test/configs/atom2.config
A somo/somo/test/configs/dflt.config
A somo/somo/test/configs/gridnoasa.config
A somo/somo/test/configs/res1.config
A somo/somo/test/configs/res1atom1.config
A somo/somo/test/configs/res1atom2.config
A somo/somo/test/configs/res2.config
A somo/somo/test/configs/res2atom1.config
A somo/somo/test/configs/res2atom2.config
A somo/somo/test/configs/rrr.config
A somo/somo/test/data/FG_99.dat
A somo/somo/test/data/HMWFG_34_HPLC_bs_pk6_t193_n.dat
A somo/somo/test/data/notes
A somo/somo/test/ref/grid/atom1-0GAUGG_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/atom1-0GAUGG_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/atom1-1HEL_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/atom1-1HEL_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/atom2-0GAUGG_1-a2b.bead_model
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A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0APA_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0APAoxt_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0APAoxt_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0APP_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0APP_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0APPoxt_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0APPoxt_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0AP_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0AP_1-a2b.hydro_res
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A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0APoxt_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0GGGG_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0GGGG_1-a2b.hydro_res
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A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0GGG_1-a2b.hydro_res
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A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0GPPoxt_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0GPPoxt_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0GP_1-a2b.bead_model
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A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0GPoxt_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0GPoxt_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0G_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0G_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0Goxt_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0Goxt_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0NRN_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0NRN_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PAP_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PAP_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PAPoxt_1-a2b.bead_model
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A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PA_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PA_1-a2b.hydro_res
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A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PAoxt_1-a2b.hydro_res
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A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PGPoxt_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PG_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PG_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PGoxt_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PGoxt_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PPA_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PPA_1-a2b.hydro_res
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PPAoxt_1-a2b.bead_model
A somo/somo/test/ref/grid/dflt-0PPAoxt_1-a2b.hydro_res
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A somo/src/us_saxs_util_sgp.cpp
A somo/src/us_saxs_util_sgp_phys.cpp
A somo/src/us_saxs_util_static.cpp
A somo/src/us_sh.cpp
A somo/src/us_surfracer.cpp
A somo/src/us_svd.cpp
A somo/src/us_tar.cpp
A somo/src/us_thread.cpp
A somo/src/us_timer.cpp
A somo/src/us_util.cpp
A somo/src/us_vector.cpp
A somo/src/us_vvv.cpp
A somo/src/us_write_config.cpp
A somo/src/us_zeno_cxx.cpp
A somo/src/us_zeno_cxx_nf.cpp
A somo/uname.pri
R somo/us2somoto3.pl
R somo/us2somoto3direct.pl
R somo/us2tosomoonly.pl
A somo/us3_config/main.cpp
A somo/us3_config/ultrascan.icns
A somo/us3_config/us3_config.pro
A somo/us3_config/us3_config.rc
A somo/us3_hydrodyn/main.cpp
A somo/us3_hydrodyn/us3_hydrodyn.pro
A somo/us3_hydrodyn/us3_somo.rc
R somo/us3add.pl
R somo/us3add.txt
R somo/us3button.pl
R somo/us3conv.hydrodyn.txt
R somo/us3conv.pl
R somo/us3conv.txt
R somo/us3updates.pl
A somo/us_admin/main.cpp
A somo/us_admin/ultrascan.icns
A somo/us_admin/us_admin.pro
A somo/us_cluster_server_t/main.cpp
A somo/us_cluster_server_t/us_cluster_server_config.h
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A somo/us_cluster_server_t/us_cluster_server_sockets.h
A somo/us_cluster_server_t/us_cluster_server_t.pro
A somo/us_saxs_cmds_mpi/main.cpp
A somo/us_saxs_cmds_mpi/us_saxs_cmds_mpi.pro
A somo/us_saxs_cmds_mpi_cuda/main.cpp
A somo/us_saxs_cmds_mpi_cuda/makecuda
A somo/us_saxs_cmds_mpi_cuda/makecuda2
A somo/us_saxs_cmds_mpi_cuda/us_cuda.cu
A somo/us_saxs_cmds_mpi_cuda/us_cuda.h
A somo/us_saxs_cmds_mpi_cuda/us_saxs_cmds_mpi_cuda.pro
A somo/us_saxs_cmds_mpi_cuda/us_semaphore.cpp
A somo/us_saxs_cmds_mpi_cuda/us_semaphore.h
A somo/us_saxs_cmds_t/main.cpp
A somo/us_saxs_cmds_t/makecuda
A somo/us_saxs_cmds_t/us_cuda.cu
A somo/us_saxs_cmds_t/us_cuda.h
A somo/us_saxs_cmds_t/us_saxs_cmds_t.pro
A somo/us_somo.pro
A somo/version.sh
R us_somo/COPYING
R us_somo/LICENSE
R us_somo/LICENSE.txt
R us_somo/add_to_bin/iftci_linux64
R us_somo/add_to_bin/iftci_osx10.8
R us_somo/add_to_bin/iftci_win64.exe
R us_somo/attic/INSTALL
R us_somo/attic/docs/calc.c
R us_somo/attic/docs/models.doc
R us_somo/attic/docs/step.table
R us_somo/attic/make_tardistro.sh
R us_somo/develop/3dplot/D_calc.cpp
R us_somo/develop/3dplot/D_calc.h
R us_somo/develop/3dplot/README
R us_somo/develop/3dplot/colormapreader.cpp
R us_somo/develop/3dplot/colormapreader.h
R us_somo/develop/3dplot/femreader.h
R us_somo/develop/3dplot/functions.h
R us_somo/develop/3dplot/lightingdlg.cpp
R us_somo/develop/3dplot/lightingdlg.h
R us_somo/develop/3dplot/lightingdlgbase.cpp
R us_somo/develop/3dplot/lightingdlgbase.h
R us_somo/develop/3dplot/lightingdlgbase.ui
R us_somo/develop/3dplot/mesh.cpp
R us_somo/develop/3dplot/mesh2mainwindow.cpp
R us_somo/develop/3dplot/mesh2mainwindow.h
R us_somo/develop/3dplot/mesh2mainwindowbase.cpp
R us_somo/develop/3dplot/mesh2mainwindowbase.h
R us_somo/develop/3dplot/mesh2mainwindowbase.ui
R us_somo/develop/3dplot/notes
R us_somo/develop/cmdline.pri
R us_somo/develop/debug.sh
R us_somo/develop/doc/Doxyfile
R us_somo/develop/doc/README
R us_somo/develop/doc/colors.pl
R us_somo/develop/doc/hplctree.txt
R us_somo/develop/doc/hydrotree.txt
R us_somo/develop/doc/sastree.txt
R us_somo/develop/doc/somotree.txt
R us_somo/develop/doc/tree.pl
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R us_somo/develop/include/us_editor.h
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R us_somo/develop/include/us_hydrodyn_csv_viewer.h
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R us_somo/develop/local.pri.template
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R us_somo/develop/local.pri.template.osx
R us_somo/develop/local.pri.template.win32mingw
R us_somo/develop/make-somodoc.sh
R us_somo/develop/mkpropri.pl
R us_somo/develop/pm_worker/make_mic
R us_somo/develop/pm_worker/make_mpi
R us_somo/develop/pm_worker/manifest
R us_somo/develop/pm_worker/pm_worker.cpp
R us_somo/develop/pm_worker/pm_worker.h
R us_somo/develop/pm_worker/pm_worker_fitness.cpp
R us_somo/develop/pm_worker/pm_worker_main.cpp
R us_somo/develop/pm_worker/pm_worker_objects.cpp
R us_somo/develop/shd_mpi/1hel.dat
R us_somo/develop/shd_mpi/1hel_f.dat
R us_somo/develop/shd_mpi/bigtest.dat
R us_somo/develop/shd_mpi/bigtest.pdb
R us_somo/develop/shd_mpi/bigtest_f.dat
R us_somo/develop/shd_mpi/crysol32
R us_somo/develop/shd_mpi/crysol64
R us_somo/develop/shd_mpi/main.cpp
R us_somo/develop/shd_mpi/make_mic
R us_somo/develop/shd_mpi/make_mpi
R us_somo/develop/shd_mpi/make_shs
R us_somo/develop/shd_mpi/make_xhost
R us_somo/develop/shd_mpi/pentamer.dat
R us_somo/develop/shd_mpi/pentamer.pdb
R us_somo/develop/shd_mpi/pentamer_f.dat
R us_somo/develop/shd_mpi/saxs_util_make_erf.cpp
R us_somo/develop/shd_mpi/shd.cpp
R us_somo/develop/shd_mpi/shd.h
R us_somo/develop/shd_mpi/shd_compute.cpp
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R us_somo/develop/shd_mpi/shd_sh.h
R us_somo/develop/shd_mpi/shs.cpp
R us_somo/develop/shd_mpi/shs.h
R us_somo/develop/shd_mpi/shs_data.h
R us_somo/develop/shd_mpi/shs_main.cpp
R us_somo/develop/shd_mpi/shs_use.cpp
R us_somo/develop/shd_mpi/shs_use.h
R us_somo/develop/shd_mpi/test/mpitest.c
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